百花生物集团公司下有全资子公司山东菏泽百花生物科技有限公司、山东菏泽地益生物科技有限公司、青岛根实生物科技有限公司、北京市绿泉科技发展有限公司、烟台沃土生物科技有限公司、山东单县大衣哥生物科技有限公司。